序列分析工具集
从 FASTA 到结构化表格:批量解析、区域提取、位点比对,输出可以直接进报告的图和表。
- Python
- Biopython
- pandas
基本都是「自己痛过,所以自己解决」的产物。能公开的就放上来。
从 FASTA 到结构化表格:批量解析、区域提取、位点比对,输出可以直接进报告的图和表。
把手工拼半天的结果整理成一份能直接发出去的图表报告,支持批量跑和模板化。
多源检索 → 结构化抽取 → 周报生成,交给模型编排,人只负责判断和取舍。
在网络受限的环境里把开源模型跑起来并接进日常工作流。一键、幂等、可重复执行。
批量转换、重命名、抽取表格与图表。把机械操作从日常里彻底拿掉。
把工作里反复出现的需求做成能复用的工具——命令行脚本、小工具、批处理流程。
踩过的坑、想明白的事,以及一些没什么用但挺有意思的记录。
我在生物医药研发一线做事,主要方向是抗体药物开发。 工作里有很大一部分时间花在数据处理、序列分析和文档整理上——这些事重复、琐碎、容易出错, 也最适合交给代码。
所以我写工具。从序列分析脚本到实验报表自动化,从情报监测到本地大模型部署, 基本都是「自己痛过,所以自己解决」。写完之后如果能帮到别人,就顺手分享出来。
AI 既是我的主要研究方向,也是我每天在用的东西。 我相信未来的研发工作流一定是人和模型分工的——人负责判断与取舍, 模型负责检索、整理和那些重复劳动的替代。